名义作出的决定， 郑克臧并无异议， 只是提出“本人或祖辈曾经出任过伪职及投考过伪朝科举的只要能举城或率部来投且愿意接受明郑方面统一调度”可试作改过自新不再按汉奸论处治罪。
内阁对郑克臧态度的变化有些摸不着头脑，但理解的要服从，不理解的也要服从，于是便以武定帝的名义“大赦”天下，这份诏书连同武定帝登基诏书很快传遍了整个明郑统治区并向桂、湘、赣、浙、苏、鲁等地传播开去，不但迅速稳定了明郑统治区内的人心，更是清廷统治下的各地士绅进一步发生了动摇。
当然决定南中国归属的还是武力，各路清军在进驻绍兴的康熙的逼迫下格外卖力。拥有六万余兵力的浙南清军在攻入福建之后马不停蹄的向霞浦方向进击。在历时五个月的浙闽边境阻击战中损失惨重的蔡元书部不得不放弃福宁（注：福宁州治霞浦县城），退往周宁一线。接到蔡元书撤退的消息，布置在东冲半岛的郑军海龙骧师第四团当即赶赴宁德，伏波舰队本部也开进三都澳以作策应。与此同时，正在闽北作战的左右勇卫师也奉命急速返回，誓将南侵的清军挡在洞宫山脉、鹫峰山脉、太姥山脉和天湖山脉构成的重“门”（注：宁德的地形呈门字型梯状）之中。
左右勇卫军师的撤离导致了闽北郑军力量骤然减弱，浙西清军顺势突破仙霞古道突入浦城境内，洪拱柱旋即将主力撤往建宁府（建瓯）整顿，其余小股兵力在闽西北武夷山的崇山峻岭中反复袭扰迟滞清军，清军虽然突入福建，但步履已然缓慢。
赣南的清军在打退了王新化的进攻后也有心向闽西或闽西北进击，然而郑军向粤北的快速进军使得兵力有限的于成龙不敢轻举妄动。在援闽还是援粤的问题上犹豫不定了许久之后，身兼江西提督的于成龙方现自己只能选择汀州方向的王新化作为突破口。可是好不容易翻越大山的赣省绿营却在汀州府城下撞得鼻青脸肿，王新化部又以奇兵再出宁化，威胁石城，素不知兵的于成龙只能焦头烂额的撤回瑞金。
既然清军在福建方向的进展可以用步履维艰来形容，因此整个天下的目光不得不投向或许可以扭转乾坤的广东战场。此时，攻克韶关的何乾部遇到了自湖广迤逦而来的鄂省绿旗兵郧阳镇、宜昌镇、湖南绿营永州镇等部及荆州驻防八旗的挑战。但蔚岭、大庾岭、大东山、瑶岭山、起微山、青云山由北及南依次横亘在韶关境内，清军只能沿武江谷地缓步推进，一时半会也对郑军无可奈何。至于肇庆方向，毛洪言已经溯西江推进到德庆，而且与韶关方向的武江、浈江的水文条件不同的是，西江江宽水深，郑军的巡航船固然不敢深入，但改装后的浅水炮船及普通的千料通报船却还是能从容驶入的。有了水师炮船的助战，并无内河水师建制的广西清军根本无法突破郑军的防线，双方在德庆城下几度交手，郑军屡屡发炮，轰得清军鬼哭狼嚎，却无法前进一步。
就在这闽粤战事纷纷扰扰之际，几乎没有人注意到本该在福州城中主持大局的郑克臧已经消失不见了，甚至就连明郑方面的部分大员也没有发现，现而