令正式撤销编制过大的水师一级，将现有六大水师重编为十一个舰队，这十一个舰队以数字编列，其负责海域如下：
第一舰队负责扶桑西海岸北部以及鲸须（阿留申）群岛海域，舰队之下辖扶桑新土港镇守府和两个巡洋舰中队、两个巡航船中队、四个军输船中队以及四个信报船中队；
第二舰队负责鲸海、苦无海及伊豆诸岛以东至鲸须群岛间海域的巡防任务，下辖窝阔湾、壹崎、庙屯、鄂霍茨克、石狩川港、钏路港等六个镇守府和十个巡航船中队、六个军输船中队以及六个信报船中队；
第三舰队负责辽海、黄水洋、朝鲜西海岸、济县附近及对马海峡、关门海峡等海域的拱卫，下辖大沽、旅顺、胶澳、西归浦等四个镇守府和四个巡洋舰中队、四个巡航船中队、五个军输船中队以及三个信报船中队；
第四舰队负责东大洋、浙海以及九州岛西海岸的巡航任务及长江入海口的拱卫，下辖大衢山、松崇、玉环、三都澳等四个镇守府和四个巡洋舰中队、四个巡航船中队、六个军输船中队以及三个信报船中队；
第五舰队负责闽海、台海、琉球及伊豆诸岛以西日本东海岸的巡航任务，下辖基隆、海坛、高雄、南澳、琉球等五个镇守府和四个巡洋舰中队、四个巡航船中队、四个军输船中队以及三个信报船中队；
第六舰队负责粤海、琼海以及西沙诸岛、东沙诸岛、中沙诸岛周边海域的巡防，下辖香山澳、白沙、钦州湾、安游港等四个镇守府和四个巡洋舰中队、三个巡航船中队、四个军输船中队以及三个信报船中队；
第七舰队负责安南、越南、金兰外海及暹罗湾周边至马来半岛北海岸的巡航震慑，下辖金兰、豆蔻（磅逊）港、富国岛、宋卡港等四个镇守府和六个巡航船中队、四个军输船中队以及三个信报船中队；
第八舰队负责中沙诸岛、南沙诸岛、婆罗洲北部海域、吕宋海域、苏禄海域的镇戍及东部太平洋群岛的探查，下辖新晋、纳闽、长岛港、山（打根）港、马（尼拉）港、桑（切斯将军）城等六个镇守府和九个巡航船中队、七个军输船中队、六个信报船中队；
第九舰队负责东印度群岛东部海域及方丈周边海域的巡防并探索衣洲以东岛域，下辖安汶、万鸦老、巴厘巴板、衣洲港、方丈南港、方丈东港、方丈西港等七个镇守府和十二个巡航船中队、十一个军输船中队以及七个信报船中队；
第十舰队负责东印度群岛东部海域、马六甲海峡、苏门答腊南部海域的镇戍和巡航，下辖凌牙门、普吉、槟城、椰城（巴达维亚）、泗水、马辰、坤甸等七个镇守府和六个巡洋舰中队、十一个巡航船中队、九个军输船中队以及六个信报船中队；
第十一舰队负责东天竺洋海域的巡防及对东非海岸并阿拉伯沿海地区的探索，下辖缅南、吉大港、东天竺、贾夫纳、马累等五个镇守府和四个巡洋舰中队、五个巡航船中队、五个军输船中队以及六个信报船中队。
这次水师改制中除了舰队的变化巨大之外，另外一个显