历时三年,启明军稳扎稳打陆续拿下了陕西行省、河南江北行省四川行省和江西行省四个行省，中心开花。朝廷的平乱大军元帅都换了几次，过程虽各有输赢，然启明军却一直在逐步壮大。
期间也打过许多伤亡惨重的艰难战役，地方起义军如周子旺、韩山童所部纷纷被剿灭，原天鹰教所部也从江浙行省败退，进入明教所占区，正式并入启明军。
周子旺是五散人之一彭和尚彭莹玉的弟子。周子旺义军失败后，彭莹玉带着周子旺的幼子周兴和残部逃回,路过汗水又带上了受他们牵连的渔民之女周芷若。而韩山童部被剿灭后，任慈率领丐帮好手接应残留部队,带回了韩山童的儿子韩林儿。
石慧将周芷若和心思单纯的韩林儿收入门下,周兴则被送到了刘基门下。周子旺和韩山童虽然都是明教弟子，却都曾称王。周兴和韩林儿既然是两人的儿子，石慧也要防备将来生出不该有的野心。
周兴虽然年纪小些,却颇有些城府，石慧将他送到刘基门下,便是不让他接触军队，学习政务,将来走文官的路子。韩林儿年长,比宋青书还大两岁，但是性格却比较简单,石慧就将他收入门下,传授武功,带在身边。
战事上，启明军的这种推进方式拉长战线的同时，也切断了朝廷南北联系，让朝廷对南方各省的控制减弱。
对于已经占领的行省，石慧迅速废除朝廷的所有苛捐杂税，整顿吏治，让明军占领区相对稳定发展。保证投降乡绅利益，又用明教善于商贾之道的弟子出面，拿出大量先进生产技术与乡绅地主合作。
乡绅地主以土地、资金，明教提供生产技术，开设工坊招募女工。如此不仅发展了明教所占区的经济，募集军费，也拉拢了地方乡绅地主，减少了乡绅地主勾结朝廷，让启明军腹背受敌的可能性。
农民起义，最大的阻力往往不是来自腐朽的朝廷军队。许多地方乡绅为了避免被起义军劫掠大多会选择与朝廷合作。启明军纪律严明，保证所有人的合法权益，又不时拉出一些朝廷死忠份子杀鸡儆猴，极大地震慑和稳住了他们。
到了启明军举事的第四个年头，随着启明军与朝廷开始分庭抗礼，明教占领区经济发展，周边行省大量饱受迫害的百姓逃入四省。启明军为军属优先分配田地、安排工作机会的号召下，大量青壮年为了家人主动参军。
外面的战火纷飞，丝毫没有影响到蝴蝶谷的美丽。不过如今的蝴蝶谷却已经不像过去那么寂静。
胡青牛和王难姑奉命在蝶谷为启明军培训了许多外科大夫和战场救援人员。一些重伤员从前线退下来后，也会送到蝶谷医治。规范有效的救援挽救了许多启明军的伤员性命，大大降低了启明军伤员的死亡率。
胡青牛不喜欢喧哗，于是在蝶谷养伤的将士也不敢随意喧哗。虽然胡青牛不会对启明军将士下手，但是惹怒了大夫，多给扎两针，或是药里多加一两黄连这种事情还是很容易的。
虽然住了不少人，却还算安静的